Livro Caixa até 1843, com registos de receita e despesa. Os registos constam de data (ano, mês e dia), descritivo da receita / despesa e colunas de valores em papel, metal e total. As folhas estão encabeçadas pelo título: Caixa da Irmandade de São Miguel e Almas. A partir de 1844 começa novo tipo de registo, com a receita e a despesa classificada pelas suas diferentes “espécies” ou verbas. Tem termo de aprovação das contas no final de cada ano. Tem Auto de Conta da Irmandade (f. 61 v.º-62), segundo as Instruções e modelo apresentados em 8 de Agosto de 1838 e 12 de Novembro de 1843. Contém as contas de receita e despesa da Irmandade de S. Miguel e Almas de 1826 a 1859. A conta de 1859 tem o termo de aprovação datado de 1860-04-15, seguido do Auto de tomada de contas pelo Administrador do Bairro Alto datado de 1863-03-11 e o Acórdão do Conselho de Distrito, assinado pelo Governador Civil e membros do Conselho, em 1863-05-05 (f. 91). Possui dois termos de abertura, um assinado pelo juiz da Irmandade António Mazziotti, datado de 1826-03-08 e outro pelo Administrador do Bairro Alto, datado de 1842-09-17. Os fólios são também numerados e rubricados duas vezes pelos mencionados acima, com numerações diferentes (respectivamente 94 e 97 folhas). Tesoureiros: Simão José de Oliveira (1826-1832); António Mazziotti Júnior (1832-1843); Manuel Joaquim dos Santos (1843).
24 maços de documentos de receita e despesa: Maço 1 - 42 doc. de 1826 (1826-03-08 - 1827-01-04); Maço 2 - 90 doc. de 1827 a 1829 (1827-02-02 - 1829-12-31); Maço 3 - 33 doc. de 1830 (1830-01-25 - 1830-12-31); Maço 4 - 29 doc. de 1831 (1831-01-03 - 1831-12-31); Maço 5 - 60 doc. de 1832 e 1833 (1832-01-01 - 1834-03-20); Maço 6 - 26 doc. de 1834 (1834-01-01 - 1834-11-11); Maço 7 - 28 doc. de 1835 (1835-01-31 - 1835-12-31); Maço 8 - 26 doc. de 1836 (1836-01-21 - 1836-12-31); Maço 9 - 31 doc. de 1837 (1837-01-10 - 1837-12-31); Maço 10 - 44 doc. de 1838 e 1839 (1838-01-31 - 1839-12-31); Maço 11 - 21 doc. de 1840 (1840-01-17 - 1840-12-31); Maço 12 - 30 doc. de 1841 (1841-01-31 - 1841-12-31); Maço 13 - 31 doc. de 1842 (1842-01-31 - 1842-12-31) e em anexo o Orçamento da receita e despesa para o ano de 1846; Maço 14 - 36 doc. de 1843 (1843-02-01 - 1843-12-31) e em anexo o Orçamento da receita e despesa para o ano de 1843 a 1844; Maço 15 - 165 doc. de 1844 a 1846 (1844-01-31 - 1846-12-31); Maço 16 - 62 doc. soltos de 1845 a 1852 (1845-05-05 - 1852-05-24); Maço 17 - 84 doc. de 1847 a 1849 (1847-01-31 - 1849-06-30); Maço 18 - 81 doc. de 1851 a 1853 (1851-01-31 - 1853-12-31); Maço 19 - 58 doc. de 1854 a 1856 (1854-02-25 - 1856-12-31); Maço 20 - 42 doc. de 1857 a 1859 (1857-11-26 - 1859-12-16); Maço 21 - 59 doc. de 1860 e 1860/61 (1860-04-17 - 1861-06-30); Maço 22 - 78 doc. de 1861/62 a 1862/63 (1861-08-05 - 1863-06-30); Maço 23 - 41 doc. de 1863/64 (1863-07-31 - 1864-07-20); Maço 24 - 200 doc. de 1864 a 1879 (1864-07-31 - 1879-11-30).
Duas relações com títulos diferentes e conteúdos semelhantes: uma primeira relação, com o título (igual ao título inscrito no rosto): «Relação dos Irmãos da Irmandade do Archanjo S. Miguel e Almas Erecta na Parochial Igreja de N. S. da Encarnação» (f. 1-4) e uma segunda relação, com o título: «Relação das viuvas dos Irmãos e mesmo Irmãs da Irmandade do Archanjo S. Miguel e Almas da Freguesia de N. S. da Encarnação» (f. 6). Em ambas se indicam o nome e morada do irmão e no campo de observações se faleceu, se é pobre, não quer pagar, entre outras e na segunda relação apresenta, além daqueles elementos o nome da irmã viúva de irmão ou irmã por si mesma, da Irmandade de S. Miguel e Almas.
Assentos organizados cronologicamente. Cada assento apresenta um termo inicial indicando a data da reunião dos irmãos eleitos em Junta Grande para tomarem posse dos lugares da Mesa para os quais tinham sido eleitos e o compromisso assumido por estes de satisfazer o pagamento das jóias que lhes cabem pelos lugares que assumem. A seguir a este termo apresenta uma lista, em colunas, com indicação do cargo, nome, valor da jóia, valor para os pobres e total, a seguir à qual se faz o termo final, assinado pelos membros da Mesa eleitos presentes na reunião. Não possui termos de abertura e encerramento.
Relação dos irmãos da Irmandade de S. Miguel e Almas, indicando o número do irmão na lista, as folhas referentes aos livros de Admissão na Irmandade e das Presidências respectivas, nome, morada e um campo de observações (falecimento e data, sufrágios, dívida, mudança de residência, falecimento da esposa, data ou habilitação da viúva de irmão falecido, etc.). Existem duas listas, uma com assentos entre 1826 e 1866 (f. 1 a 5) e outra de 1867 em diante (f. 6 a 15).
Livro das actas das conferências da Mesa e da Junta Grande da Irmandade de S. Miguel e Almas, organizadas cronologicamente. Por vezes, à margem, surge inscrito o tema ou assunto da conferência e a data abreviada da conferência. Nalgumas das conferências realizam-se as transcrições dos documentos que deram origem às resoluções tomadas, como requerimentos, ofícios e cartas, fazendo referência à votação e seu resultado. Inclui outro tipo de registos, como os autos de posse de empregados da Irmandade e termos de posse dos membros da Mesa e Assembleia-geral ou Junta, recepção da Irmandade dos Clérigos Pobres na Igreja da Encarnação, procurações, etc. Não possui termos de abertura e encerramento.
Diversos documentos recebidos pela Irmandade de S. Miguel e Almas, como sejam, requerimentos, ofícios e cartas, que foram apresentados ou referidos em sessões da Mesa da Irmandade, tendo sido objecto de despacho pela mesma. Existem ainda algumas transcrições e minutas das actas das sessões da Mesa. Referem-se a assuntos diversos: pedidos de esmolas pelos irmãos pobres, pedidos de emprego, renúncia de irmãos a cargos para os quais foram eleitos, contas da Irmandade com o Tesoureiro, apresentação de contas ao Regedor da Paróquia, comutação de legados pios, inscrição de escrituras de hipoteca, entre muitos outros.
Os assentos indicam: o nome do irmão, morada e o número de folha do livro de "Assentos dos Irmãos", onde está registada a sua admissão e diversas observações como sejam: falecimento do irmão ou da esposa, data de falecimento, sufrágios pela sua Alma, habilitação da esposa a irmã da Irmandade, o seu nome e referência ao seu registo de admissão; se o irmão servia na Mesa; se desistiu e saiu da Irmandade; se não pagou; mudanças de residência, entre outros. Apresenta também remissiva para o livro de "Presidências" seguinte. Neste livro surge ainda a dívida dos anuais até ao fim do ano de 1826 e indicação de pago. Livro parcialmente impresso na parte de baixo da página, com quadrícula abrangendo os anos de 1827 a 1866, onde eram assentes os pagamentos anuais, indicando “pg” (pago) e a quantia paga ou então "Mesa", indicando que o irmão ocupava, naquele ano, um cargo na Mesa da Irmandade, estando isento do pagamento da anuidade. Possui um índice final, com marcadores alfabéticos, indicando o nome e página onde se localiza, neste livro, os registos dos pagamentos anuais. Os nomes dos irmãos saídos da Irmandade ou falecidos aparecem riscados, tanto nos registos como no índice.
41 cartas patente pertencentes a irmãos da Irmandade de S. Miguel e Almas e relativas ao ano de 1826.
9 cartas patente pertencentes a irmãos da Irmandade de S. Miguel e Almas: 2 relativas ao ano de 1830, 1 de 1831 e 6 do ano de 1833.
9 cartas patente pertencentes a irmãos da Irmandade de São Miguel e Almas: 2 relativas ao ano de 1826, 1 de 1827, 1 de 1829, 3 de 1844, 1 de 1845 e 1 do ano de 1853.
23 cartas patente pertencentes a irmãos da Irmandade de S. Miguel e Almas: 16 relativas ao ano de 1826 e 7 do ano de 1827.
Para o Cofre dos Pobres era canalizada parte da receita obtida com a entrada de novos irmãos (Compromisso, Cap.1.º, §4.º - que determinava a quantia de 240 réis.) e da receita obtida de parte da jóia paga por cada um dos irmãos mesários (Idem, Cap.13.º, §1.º). Em relação a cada referência de receita ou despesa apresenta a data, o descritivo da receita ou da despesa, a referência ao Livro Caixa (folha e número) e o valor recebido ou despendido.
Livro de partidas dobradas Deve/Haver. Indica-se a data, descritivo da receita, referência ao Livro Caixa (folha e número) e o valor recebido.
34 cartas patente pertencentes a irmãos da Irmandade de S. Miguel e Almas: 26 relativas ao ano de 1827, 2 de 1828 e 6 do ano de 1829.